新冠肺炎疫情防控期间，市医疗保障局督促各级医保经办机构推出系列便民举措，广大参保单位、参保人通过“网上办理、电话咨询办理或延后办理”等便利途径办理了医保业务，有效确保疫情期间医保经办工作平稳有序正常开展。
积极推行医保业务“不见面办”。该局督促各级医保经办机构及时发布公告，引导各参保单位、参保人员充分利用全区“数字人社”网上服务大厅、“广西人社12333”APP、“广西人社服务”及微信公众号和业务工作QQ群等办理医保业务，减少因人员聚集流动造成疫情传播的安全风险。2月3日，市医保经办机构受理德保县医保中心“邮寄办”申请，网上回拨德保医保中心申请的2019年12月城乡居民医保基金17055364.12元；2月6日网上办理回拨右江区医保中心申请的2019年12月城乡居民医保基金8455172.65元。
平果县四塘镇印山村群众韦某某，在广东务工期间因脑动脉瘤破裂出血于1月24日至2月4日在中山市人民医院住院，产生医疗费用136971.07元。因费用较大，且在外地就医，患者筹集资金比较因难，韦某某于2月4日致电平果县医保中心，申请在中山市人民医院报销。该局经办工作人员让患者加入平果县城乡居民医保异地备案工作QQ群，将备案需要的材料拍图片传送到群里，后经5次电话沟通后成功备案，并将信息上传到中山市人民医院。当天患者在中山市人民医院成功报销基本医疗保险85566.53元，解决了燃眉之急。
探索试行容缺受理和事后补交材料。1月30日，接到疫情防控任务后，市医保经办机构紧急预拨基金，增强医院防控费用保障，第一时间预拨给右江区医保中心600万元；2月3日又预拨靖西医保中心100万元，保障医疗机构不因医保支付影响救治工作。同时，在医保信息系统完成定点医院结算，引导定点医疗机构在“一门式系统”，即进入广西数字人社经办管理信息系统中的“两定”月结算模块操作，暂时不用报送纸质材料，待疫情解除后医院补充完善纸质材料。仅2月10日，市城乡居民医保科就经办定点医保结算12笔共计71636974.49元，有效确保定点医疗机构正常结算。
